MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070010 complete genome

Total Repeats: 100402

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019951	ACCGC	2	10	227331	227340	20 %	0 %	20 %	60 %	433629272
5002	NC_019951	CGC	2	6	227358	227363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629272
5003	NC_019951	CGA	2	6	227391	227396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629272
5004	NC_019951	GCAGG	2	10	227416	227425	20 %	0 %	60 %	20 %	433629272
5005	NC_019951	CG	3	6	227450	227455	0 %	0 %	50 %	50 %	433629272
5006	NC_019951	GCT	2	6	227470	227475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629272
5007	NC_019951	GC	3	6	227537	227542	0 %	0 %	50 %	50 %	433629272
5008	NC_019951	TCG	2	6	227549	227554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629272
5009	NC_019951	CTG	3	9	227560	227568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629272
5010	NC_019951	GCCG	2	8	227674	227681	0 %	0 %	50 %	50 %	433629272
5011	NC_019951	CGG	2	6	227724	227729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629272
5012	NC_019951	GCA	2	6	227754	227759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629272
5013	NC_019951	GTC	2	6	227824	227829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629272
5014	NC_019951	GTT	2	6	227830	227835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629272
5015	NC_019951	GTG	2	6	227851	227856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629272
5016	NC_019951	CGT	2	6	227917	227922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629272
5017	NC_019951	GGT	2	6	228023	228028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629273
5018	NC_019951	CCA	2	6	228040	228045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629273
5019	NC_019951	CGG	2	6	228061	228066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629273
5020	NC_019951	CGG	2	6	228130	228135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629273
5021	NC_019951	CGG	2	6	228184	228189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629273
5022	NC_019951	CGG	2	6	228248	228253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629273
5023	NC_019951	CGG	2	6	228271	228276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629273
5024	NC_019951	CGG	2	6	228379	228384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629273
5025	NC_019951	GCA	2	6	228424	228429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629273
5026	NC_019951	GCA	2	6	228490	228495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629273
5027	NC_019951	GCA	3	9	228502	228510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629273
5028	NC_019951	TGC	2	6	228537	228542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629273
5029	NC_019951	GCC	2	6	228546	228551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629273
5030	NC_019951	CGA	2	6	228583	228588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629273
5031	NC_019951	CAG	2	6	228601	228606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629273
5032	NC_019951	CCAG	2	8	228634	228641	25 %	0 %	25 %	50 %	433629273
5033	NC_019951	CCA	2	6	228658	228663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629273
5034	NC_019951	CGGA	2	8	228670	228677	25 %	0 %	50 %	25 %	433629273
5035	NC_019951	GCC	2	6	228688	228693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629273
5036	NC_019951	CGGC	2	8	228710	228717	0 %	0 %	50 %	50 %	433629273
5037	NC_019951	CAGG	2	8	228740	228747	25 %	0 %	50 %	25 %	433629273
5038	NC_019951	TGG	2	6	228751	228756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629273
5039	NC_019951	GCA	2	6	228823	228828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629273
5040	NC_019951	CGT	2	6	228853	228858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629273
5041	NC_019951	TCG	2	6	228942	228947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629273
5042	NC_019951	AGC	2	6	229025	229030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629273
5043	NC_019951	ACC	2	6	229053	229058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629273
5044	NC_019951	ACG	2	6	229105	229110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629274
5045	NC_019951	CCGCG	2	10	229126	229135	0 %	0 %	40 %	60 %	433629274
5046	NC_019951	GGT	2	6	229139	229144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629274
5047	NC_019951	CGC	2	6	229176	229181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629274
5048	NC_019951	CGGC	2	8	229210	229217	0 %	0 %	50 %	50 %	433629274
5049	NC_019951	ACC	2	6	229237	229242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629274
5050	NC_019951	GCG	2	6	229381	229386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629274
5051	NC_019951	CGG	2	6	229450	229455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629274
5052	NC_019951	GGC	2	6	229457	229462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629274
5053	NC_019951	GCC	2	6	229494	229499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629274
5054	NC_019951	CGT	2	6	229511	229516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629274
5055	NC_019951	TC	3	6	229558	229563	0 %	50 %	0 %	50 %	433629274
5056	NC_019951	GGT	2	6	229574	229579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629274
5057	NC_019951	ACA	2	6	229588	229593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433629274
5058	NC_019951	CAC	2	6	229608	229613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629274
5059	NC_019951	CCGG	2	8	229623	229630	0 %	0 %	50 %	50 %	433629274
5060	NC_019951	CG	3	6	229638	229643	0 %	0 %	50 %	50 %	433629274
5061	NC_019951	CTG	2	6	229644	229649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629274
5062	NC_019951	CGC	2	6	229693	229698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629274
5063	NC_019951	TGC	2	6	229705	229710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629274
5064	NC_019951	TG	3	6	229764	229769	0 %	50 %	50 %	0 %	433629274
5065	NC_019951	CGA	2	6	229850	229855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629274
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5067	NC_019951	CGG	2	6	230040	230045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629275
5068	NC_019951	CATC	2	8	230046	230053	25 %	25 %	0 %	50 %	433629275
5069	NC_019951	GCG	2	6	230132	230137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629275
5070	NC_019951	CGG	2	6	230184	230189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629275
5071	NC_019951	ACG	2	6	230193	230198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629275
5072	NC_019951	TGG	2	6	230289	230294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629275
5073	NC_019951	CCTCG	2	10	230323	230332	0 %	20 %	20 %	60 %	433629275
5074	NC_019951	CGA	2	6	230352	230357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629275
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5079	NC_019951	CCG	2	6	230568	230573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629275
5080	NC_019951	TCG	2	6	230579	230584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629275
5081	NC_019951	GC	3	6	230593	230598	0 %	0 %	50 %	50 %	433629275
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5084	NC_019951	TCGGT	3	15	230823	230837	0 %	40 %	40 %	20 %	433629276
5085	NC_019951	GAC	2	6	230860	230865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629276
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5087	NC_019951	GC	3	6	230926	230931	0 %	0 %	50 %	50 %	433629276
5088	NC_019951	GGC	2	6	230934	230939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629276
5089	NC_019951	GGC	2	6	230965	230970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629276
5090	NC_019951	CCG	2	6	231002	231007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629276
5091	NC_019951	CGT	2	6	231153	231158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629276
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5094	NC_019951	CGA	3	9	231233	231241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629277
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5098	NC_019951	GC	3	6	231519	231524	0 %	0 %	50 %	50 %	433629277
5099	NC_019951	GC	3	6	231567	231572	0 %	0 %	50 %	50 %	433629277
5100	NC_019951	GTT	2	6	231617	231622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629277
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5103	NC_019951	CGA	3	9	231679	231687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629277
5104	NC_019951	CTGG	2	8	231725	231732	0 %	25 %	50 %	25 %	433629277
5105	NC_019951	TTG	2	6	231771	231776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629277
5106	NC_019951	GGC	2	6	231821	231826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629277
5107	NC_019951	ACA	2	6	231829	231834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433629277
5108	NC_019951	GC	3	6	231952	231957	0 %	0 %	50 %	50 %	433629277
5109	NC_019951	GGCC	2	8	231959	231966	0 %	0 %	50 %	50 %	433629277
5110	NC_019951	GTGCG	2	10	231977	231986	0 %	20 %	60 %	20 %	433629277
5111	NC_019951	ACCG	2	8	232023	232030	25 %	0 %	25 %	50 %	433629277
5112	NC_019951	GCC	2	6	232038	232043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629277
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5116	NC_019951	CGCT	2	8	232231	232238	0 %	25 %	25 %	50 %	433629277
5117	NC_019951	CGG	2	6	232268	232273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629277
5118	NC_019951	G	6	6	232328	232333	0 %	0 %	100 %	0 %	433629277
5119	NC_019951	CTG	2	6	232395	232400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629277
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5121	NC_019951	AGTTCG	2	12	232447	232458	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433629277
5122	NC_019951	CGG	2	6	232474	232479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629277
5123	NC_019951	CG	3	6	232493	232498	0 %	0 %	50 %	50 %	433629277
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5234	NC_019951	CAC	2	6	237890	237895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629282
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5240	NC_019951	CTGGC	2	10	238016	238025	0 %	20 %	40 %	40 %	433629282
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5242	NC_019951	TGG	2	6	238068	238073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629282
5243	NC_019951	TCG	2	6	238110	238115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629282
5244	NC_019951	CGG	2	6	238131	238136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629282
5245	NC_019951	CTG	2	6	238193	238198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629282
5246	NC_019951	CCG	2	6	238236	238241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629282
5247	NC_019951	TGC	2	6	238251	238256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629282
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5270	NC_019951	TGG	2	6	239188	239193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629283
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5349	NC_019951	GTC	2	6	242428	242433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629285
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5354	NC_019951	GCT	2	6	242571	242576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629285
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5357	NC_019951	ATGG	2	8	242625	242632	25 %	25 %	50 %	0 %	433629285
5358	NC_019951	GCA	2	6	242642	242647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629285
5359	NC_019951	TTG	2	6	242663	242668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629285
5360	NC_019951	GCCT	2	8	242677	242684	0 %	25 %	25 %	50 %	433629285
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5362	NC_019951	CCGA	2	8	242784	242791	25 %	0 %	25 %	50 %	433629285
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5458	NC_019951	CG	4	8	246966	246973	0 %	0 %	50 %	50 %	433629287
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5463	NC_019951	CTG	3	9	247159	247167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629287
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5474	NC_019951	CGG	2	6	247535	247540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629288
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5476	NC_019951	CGG	2	6	247643	247648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629288
5477	NC_019951	CG	3	6	247654	247659	0 %	0 %	50 %	50 %	433629288
5478	NC_019951	TCG	2	6	247690	247695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629288
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5481	NC_019951	GAT	2	6	247775	247780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433629288
5482	NC_019951	GATC	2	8	247784	247791	25 %	25 %	25 %	25 %	433629288
5483	NC_019951	CGT	2	6	247793	247798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629288
5484	NC_019951	GGC	2	6	247865	247870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629288
5485	NC_019951	ACG	2	6	247906	247911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629288
5486	NC_019951	GC	3	6	247949	247954	0 %	0 %	50 %	50 %	433629288
5487	NC_019951	GAG	2	6	248007	248012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433629288
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5491	NC_019951	CAG	2	6	248082	248087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629288
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